Variété microcristalline du quartz, le calcédoine est de système rhomboédrique. La couleur, très variable, peut etre blanche, bleue, rouge, verte, marron ou noire. Les variétés de calcédoine comprennent :  le jaspe, forme opaque; l'agate, variété avec bandes concentriques de diverses couleurs, l'agate musquée avec des traces dendritiques sombres, le chrysoprase, variété verte; l'onyx à bandes parallèles. La Cornaline, est quant à elle une variété rouge à rouge-brune; la sardoine est marron clair ou foncé. Le calcédoine a des stries blanches.  Il passe du transparent au translucide ou à l'opaque, avec une luminosité de vitreuse à cireuse. Il se forme dans les cavités des divers types de roche, mais surtout dans les laves. Il peut également se former par déshydratation de l'opale. Il se différencie de l'opale par son poids spécifique élevé.